Ο Χρόνης Κυνηγός διδάσκει από το 1993 εκπαιδευτική τεχνολογία και διδακτική των μαθηματικών στον Τομέα Παιδαγωγικής του Τμήματος Φ.Π.Ψ. της Φιλοσοφικής Σχολής του Πανεπιστημίου Αθηνών. Είναι διευθυντής του Εργαστηρίου Εκπαιδευτικής Τεχνολογίας του Τομέα (http://etl.ppp.uoa.gr) και ερευνητής-εξωτερικός συνεργάτης στο Ινστιτούτο Τεχνολογίας Υπολογιστών και Εκδόσεων «ΔΙΟΦΑΝΤΟΣ» του Υπ.Ε.Π.Θ. Έχει συμμετάσχει σε επιτροπές Αναλυτικών Προγραμμάτων Σπουδών για τα Μαθηματικά και είναι Επιστημονικός Υπεύθυνος του ψηφιακού εμπλουτισμού των βιβλίων των μαθηματικών για τη βασική παιδεία. Στα ερευνητικά ενδιαφέροντά του περιλαμβάνεται η μελέτη πτυχών της μαθησιακής και διδακτικής διαδικασίας σε διερευνητικά εκπαιδευτικά περιβάλλοντα, σχεδιασμένα ώστε να αποτελούν καινοτομίες με πρόσθετη παιδαγωγική αξία. Υπήρξε μέλος της ομάδας ανάπτυξης του εκπαιδευτικού συγγραφικού εργαλείου «Αβάκιο» και ήταν υπεύθυνος για τον παιδαγωγικό του σχεδιασμό. Επιπρόσθετα επινόησε και σχεδίασε το ευρέως χρησιμοποιούμενο στα μαθηματικά παράγωγο του Αβάκιου με την ονομασία «Χελωνόκοσμος» που είναι βασισμένο στη Γεωμετρία της Χελώνας με τη γλώσσα προγραμματισμού της Logo. Είναι ιδρυτικό μέλος της Ένωσης Ερευνητών Διδακτικής των Μαθηματικών και του Ευρωπαϊκού Δικτύου Αριστείας «Καλειδοσκόπιο – Διερεύνηση της μελλούμενης μαθησιακής διαδικασίας με ψηφιακές τεχνολογίες». Διατέλεσε εκλεγμένο μέλος της διεθνούς επιτροπής του «Inter­national Group for the Psychology of Mathematics Education». Έχει δημοσιεύσει κυρίως σε ερευνητικά περιοδικά και βιβλία του εξωτερικού και έχει επιμεληθεί ένα βιβλίο με αντικείμενο την επιμόρφωση καθώς και τα πρακτικά ενός Ευρωπαϊκού και δύο Πανελλήνιων συνεδρίων. Υπήρξε ο επιστημονικός υπεύθυνος του Διαδραστικού Εκπαιδευτικού Πάρκου με το όνομα «Πολυμήχανο» http://www.youtube.com/watch?v=d8AJwADKd90 .

Από τις εκδόσεις Τόπος κυκλοφορεί το βιβλίο του Το Μάθημα της Διερεύνησης, Παιδαγωγική αξιοποίηση των ψηφιακών τεχνολογιών για τη διδακτική των μαθηματικών (2011).