Ο Σπύρος Μαρκέτος διδάσκει Ιστορία των Νεώτερων και Σύγχρονων Πολιτικών και Κοινωνικών Ιδεών στο Τµήµα Πολιτικών Επιστηµών του ΑΠΘ. Ασχολείται ερευνητικά µε την ιστορία των ιδεολογιών, µε έµφαση στον ριζοσπαστισµό και τον φασισµό, µε τον ριζοσπαστικό φεµινισµό και την ιστορία του φύλου, τον ∆ιαφωτισµό, και την ιστορία της ∆υτικής µουσικής. Είναι ιδρυτικό µέλος της Επιτροπής Λογιστικού Ελέγχου, και συµµετείχε επίσης στην Επιτροπή Αλήθειας για το δηµόσιο χρέος, της Βουλής των Ελλήνων. Έχει εκδώσει τα έργα: Πώς φίλησα τον Μουσσολίνι. Τα πρώτα βήµατα του ελληνικού φασισµού (Βιβλιόραµα, 2006)· Το πλαίσιο ενσωµάτωσης της σεφαραδικής Θεσσαλονίκης στην Ελλάδα, 1912-1914 (Εκδόσεις του Ιδρύµατος Πολιτισµού και Παιδείας της Σχολής Mωραΐτη)· Μνήµες, λήθη, ψεύδη, στον Τιµητικό τόµο της Σχολής Ν.Ο.Π.Ε. του ΑΠΘ για τον καθηγητή Ιωάννη Μανωλεδάκη, Τόµος ΙΙΙ. Φιλοσοφία δικαίου-ιστορία δικαίου, διεθνές και δηµόσιο δίκαιο, ιδιωτικό δίκαιο, πολιτική δικονοµία, πολιτικές επιστήµες (Σάκκουλας, 2007)· «Η ελληνική αριστερά», στον τόµο Β2 του Χρήστος Χατζηιωσήφ (επιµ.) Ιστορία της Ελλάδας του 20ού αιώνα. 1922-1940. Ο Μεσοπόλεµος (Βιβλιόραµα, 2002)· «Η άκρα δεξιά», στον τόµο ∆2 του Χρήστος Χατζηιωσήφ (επιµ.) Ιστορία της Ελλάδας του 20ού αιώνα. 1922-1940. Ανασυγκρότηση, Εµφύλιος, Παλινόρθωση 1945-1952 (Βιβλιόραµα, 2009).

Συμμετέχει στο συλλογικό έργο: Έξοδος Αδιέξοδος (Τόπος 2018)